Belangrijkste verschil: hagedissen zijn soort reptielen die vaak worden aangetroffen in vele variaties over de hele wereld. Gekko's zijn specifieke soorten hagedissen met brede tenen en geen oogleden. Ze worden vaak aangetroffen in warmere klimaten.
Er zijn veel verschillende soorten hagedissen die elk van elkaar verschillen. In feite zijn er meer dan 6000 verschillende soorten hagedissen. Sommige hiervan, met name 1.650 hiervan, worden geclassificeerd als gekko's. Er zijn talloze factoren die een gekko onderscheiden van andere hagedissen.
Bijna alle hagedissen zijn koelbloedig, hebben vier poten en een staart. Hoewel de meeste hagedissen een droge en schilferige huid hebben, hebben gekko's meestal een dunne huid met kleine bultjes erop. Bovendien hebben de meeste hagedissen de neiging om geklauwde voeten te hebben, terwijl gekko's een gespecialiseerd teenkussen hebben dat de neiging heeft zich te houden aan oppervlakken met behulp van natuurlijke fysica. Hierdoor kunnen ze gladde en verticale oppervlakken beklimmen, zoals muren, ramen en zelfs op plafonds lopen. Gekko's hebben ook de neiging om een dubbele verbinding te maken, waardoor ze hun voeten kunnen schillen van het oppervlak waarop ze vastzitten.