Belangrijkste verschil: Shia is een van de twee belangrijkste sekten van de islam, de andere is soenniet. Ismaili is een divisie binnen de Shia-sekte. De verdeling is te wijten aan de selectie van een imam.
Voordat je begrijpt hoe de Shias's zich splitsen in deze drie takken, is het belangrijk om te begrijpen hoe de verschillen tussen de soennieten en de sjiieten werden gevormd. Onder Mohammed werden alle moslims als één beschouwd. Mohammed wordt beschouwd als de laatste profeet van God. De verschillen volgden de dood van Mohammed. Mohammed stierf zonder officieel een erfgenaam te verklaren om de moslimgemeenschap te leiden. Er waren twee hoofdkandidaten: Abu Bakr (de schoonvader van Mohammed) en Ali (de neef en schoonzoon van Mohammed). De Soennieten koos Abu Bakr uit, die een vriend en een vertrouweling van Mohammed als kalief was om leiding te geven en advies te geven. De sjiieten geloofden echter dat het kalifaat binnen de familie van Mohammed moest blijven en daarom Ali als de leider verkoos. Ali werd het vierde kalifaat onder Soennitische heerschappij. Naast deze zijn er nog andere kleine verschillen over hoe zij bidden en wat zij geloven. Vanwege deze verschillen tussen de sjiieten en de soennieten, is er een voortdurende botsing geweest tussen de twee sekten van de islam.
Shia kreeg ook te maken met interne meningsverschillen over de imams en wie moet leiden als imam. Onder de sjiitische islam wordt een imam beschouwd als een leider die wordt opgevat als een leidraad voor alle facetten van het leven. Volgens de Shia-doctrine is de Imamah een goddelijke instelling die het instituut van het profeetschap slaagde. Ze geloven dat de imams zijn geselecteerd en geplukt door goddelijke wezens, ze hebben volledige kennis en kunnen de Qu'ran terecht interpreteren. Het verschil tussen de sji's is nu anders vanwege de selectie van imams. Ismaili is een tak van de Shia-islam die is vernoemd naar Ismail ibn Ja'far, die volgens hen de rechtmatig benoemde imam of spirituele opvolger is. Dit verschilt van de Tweevers die Mūsà al-Kāżim, de jongere broer van Ismail, geloven als de ware Imam.
Ismailisme was op een gegeven moment de grootste tak van Shisim die in de tiende en twaalfde eeuw in politieke macht was. Omdat het ismalisme een tak is en deel uitmaakt van de sjiieten, delen ze allebei veel overtuigingen, waaronder dat er maar één ware God is en dat imams de afstammelingen van Mohammed moeten zijn door zijn dochter Fatima. Zowel Shias als Ismaili geloven dat de familie van Muḥammad (Ahl al-Bayt) als goddelijk gekozen, onfeilbaar en geleid door God de Islamitische gemeenschap moet leiden.
De Nizari Ismaili is een pad (tariqah) van de sjiitische islam, met de nadruk op sociale rechtvaardigheid, pluralisme en menselijke rede in het kader van de mystieke traditie van de islam. Het wordt beschouwd als de op een na grootste tak van de islam en vormt de meerderheid van Ismaili. De Mustaali Ismaili is een sekte van Ismaili Shia Islam. Het belangrijkste verschil tussen de Nizari Ismaili en Mustaali Ismaili is wie als imam had moeten leiden. De Nizaris accepteerden Imam Nizar (de eerste) als de negentiende Imam, terwijl de Mustaalis Nizar's jongere broer Mustali beschouwen. De Nizari-moslims worden momenteel geleid door Aga Khan IV, die bekend staat als Imam Shah Karim.
Volgens Wikipedia wordt "De Musta'liyyah ook wel aangeduid als de Taiyabi of Ṭayyibī, na de laatste Imām die zij herkennen, Ṭayyib Abī l-Qāṣim. Historisch gezien was er een onderscheid tussen de Ṭayyibiyyah en de Ḥāfiziyyah, de laatste die de Fatimid heersers van Egypte (tussen 1130-1169) erkende als legitieme Imāms, en niet Ṭayyib Abī l-Qāṣim. De Hafizi-visie verloor alle steun na de val van de Fatimidische dynastie: de huidige Musta'liyya zijn allemaal Ṭayyibiyyah. De grootste Mustaali-groep is de Bohra, en de grootste Bohra-groep is de Dawoodi Bohra, voornamelijk te vinden in India. De naam Bohra is een herinterpretatie van het Gujarati-woord vahaurau ("om te ruilen"). Het Bohrā-volk bestaat uit twee hoofdgroepen: voornamelijk een handelaar in de klasse Shī'ī-meerderheid, en een Sunnī-minderheid die voornamelijk boeren zijn. "
De sjiieten en de Ismaili lijken sterk op hun overtuigingen en culturen, omdat de Ismaili een deel zijn van de sjiitische sekte. Alle sekten delen hetzelfde geloof over Allah en Mohammed. Allah wordt geloofd aan de ene en ware God, met Mohammed als de laatste profeet van God.